Клиническая биохимия
deoxyhypusine
deoxyhypusine — метаболит человека. В химическом справочнике ChEBI эта структура относится к классу «L-lysine derivative». Для неё указаны формула C10H23N3O2 и формальный заряд 0.
Что означает эта роль
При поиске метаболита в биологической пробе учитывают матрицу, способ пробоподготовки и аналитическую платформу. Сигнал с подходящей массой может принадлежать нескольким структурам. Для уверенной идентификации используют дополнительные признаки, например время удерживания или характер фрагментации.
Как прочитать формулу и массу
Формула C10H23N3O2 задаёт следующий состав одной структурной единицы: C — 10, H — 23, N — 3, O — 2. Средняя масса составляет 217.313 Да, а моноизотопная масса — 217.17903 Да. Первую используют при расчётах с усреднённым изотопным составом, вторую сопоставляют с теоретической точной массой определённого изотопного состава. В масс-спектре прибор регистрирует отношение массы к заряду иона. Для сравнения с пиком учитывают ионную форму и возможное образование аддукта.
Пример пересчёта единиц
Если в справочном примере содержание deoxyhypusine равно 10 мкмоль/л, то для формы C10H23N3O2 это приблизительно 2,17313 мг/л. Для такого пересчёта количество вещества умножают на молярную массу и согласуют приставки единиц. При использовании стандарта в виде соли или гидрата сначала проверяют, к какой форме отнесена заявленная концентрация. Пример показывает перевод единиц и не является референсным интервалом.
Как различить записи
В том же классе «L-lysine derivative» описано другое соединение — L-saccharopine с формулой C11H20N2O6. Общая классификация удобна для поиска родственных веществ. При переносе результата эксперимента важно сравнить формулы, обозначения и точную структуру исследованного материала.
Справочные данные
- Международное название
- deoxyhypusine
- Класс ChEBI
- L-lysine derivative
- Формула
- C10H23N3O2
- Формальный заряд
- 0
- Средняя масса, Да
- 217.313
- Моноизотопная масса, Да
- 217.17903
- InChIKey
- PGPFBXMCOQNMJO-VIFPVBQESA-N
- CAS RN
- 82543-85-9
- Другие обозначения в ChEBI
- N(6)-(4-aminobutyl)-L-lysine, N(6)-(4-aminobutyl)-L-lysine, N(6)-(4-Aminobutyl)lysine
ChEBI, выпуск 257, CHEBI:50038 · EMBL-EBI · CC BY 4.0