Клиническая биохимия
L-saccharopine
L-saccharopine — метаболит человека. В химическом справочнике ChEBI эта структура относится к классу «L-lysine derivative». Для неё указаны формула C11H20N2O6 и формальный заряд 0.
Что означает эта роль
При поиске метаболита в биологической пробе учитывают матрицу, способ пробоподготовки и аналитическую платформу. Сигнал с подходящей массой может принадлежать нескольким структурам. Для уверенной идентификации используют дополнительные признаки, например время удерживания или характер фрагментации.
Как прочитать формулу и массу
Формула C11H20N2O6 задаёт следующий состав одной структурной единицы: C — 11, H — 20, N — 2, O — 6. Средняя масса составляет 276.289 Да, а моноизотопная масса — 276.13214 Да. Первую используют при расчётах с усреднённым изотопным составом, вторую сопоставляют с теоретической точной массой определённого изотопного состава. В масс-спектре прибор регистрирует отношение массы к заряду иона. Для сравнения с пиком учитывают ионную форму и возможное образование аддукта.
Пример пересчёта единиц
Если в справочном примере содержание L-saccharopine равно 10 мкмоль/л, то для формы C11H20N2O6 это приблизительно 2,76289 мг/л. Для такого пересчёта количество вещества умножают на молярную массу и согласуют приставки единиц. При использовании стандарта в виде соли или гидрата сначала проверяют, к какой форме отнесена заявленная концентрация. Пример показывает перевод единиц и не является референсным интервалом.
Как различить записи
В ChEBI указана прямая связь: L-saccharopine — сопряжённая кислота для «L-saccharopinate(1-)». У этих форм различаются число протонов и заряд. При переносе результата проверяют, какая форма была выбрана для расчёта массы.
Справочные данные
- Международное название
- L-saccharopine
- Класс ChEBI
- L-lysine derivative
- Формула
- C11H20N2O6
- Формальный заряд
- 0
- Средняя масса, Да
- 276.289
- Моноизотопная масса, Да
- 276.13214
- InChIKey
- ZDGJAHTZVHVLOT-YUMQZZPRSA-N
- CAS RN
- 997-68-2
- Другие обозначения в ChEBI
- epsilon-N-(L-Glutar-2-yl)-L-lysine, N-[(5S)-5-amino-5-carboxypentyl]-L-glutamic acid, N-[(5S)-5-amino-5-carboxypentyl]-L-glutamic acid, N-[(S)-5-Amino-5-carboxypentyl]-L-glutamic acid
ChEBI, выпуск 257, CHEBI:16927 · EMBL-EBI · CC BY 4.0