Клиническая биохимия
L-homocitrulline
L-homocitrulline — метаболит человека. В химическом справочнике ChEBI эта структура относится к классу «L-lysine derivative». Для неё указаны формула C7H15N3O3 и формальный заряд 0.
Что означает эта роль
При поиске метаболита в биологической пробе учитывают матрицу, способ пробоподготовки и аналитическую платформу. Сигнал с подходящей массой может принадлежать нескольким структурам. Для уверенной идентификации используют дополнительные признаки, например время удерживания или характер фрагментации.
Как прочитать формулу и массу
Формула C7H15N3O3 задаёт следующий состав одной структурной единицы: C — 7, H — 15, N — 3, O — 3. Средняя масса составляет 189.215 Да, а моноизотопная масса — 189.11134 Да. Первую используют при расчётах с усреднённым изотопным составом, вторую сопоставляют с теоретической точной массой определённого изотопного состава. В масс-спектре прибор регистрирует отношение массы к заряду иона. Для сравнения с пиком учитывают ионную форму и возможное образование аддукта.
Пример пересчёта единиц
Если в справочном примере содержание L-homocitrulline равно 10 мкмоль/л, то для формы C7H15N3O3 это приблизительно 1,89215 мг/л. Для такого пересчёта количество вещества умножают на молярную массу и согласуют приставки единиц. При использовании стандарта в виде соли или гидрата сначала проверяют, к какой форме отнесена заявленная концентрация. Пример показывает перевод единиц и не является референсным интервалом.
Как различить записи
В ChEBI указана прямая связь: L-homocitrulline — таутомер соединения «L-homocitrulline zwitterion». Такое сопоставление требует структурного описания. Одна эмпирическая формула не передаёт всех различий между формами.
Справочные данные
- Международное название
- L-homocitrulline
- Класс ChEBI
- L-lysine derivative
- Формула
- C7H15N3O3
- Формальный заряд
- 0
- Средняя масса, Да
- 189.215
- Моноизотопная масса, Да
- 189.11134
- InChIKey
- XIGSAGMEBXLVJJ-YFKPBYRVSA-N
- CAS RN
- 1190-49-4
- Другие обозначения в ChEBI
- (2S)-2-amino-6-(carbamoylamino)hexanoic acid, (2S)-2-amino-6-(carbamoylamino)hexanoic acid, N(6)-(aminocarbonyl)-L-lysine, N(6)-carbamoyl-L-lysine
ChEBI, выпуск 257, CHEBI:17443 · EMBL-EBI · CC BY 4.0