Клиническая биохимия
3-decaprenyl-4-hydroxy-5-methoxybenzoic acid
3-decaprenyl-4-hydroxy-5-methoxybenzoic acid — метаболит человека. В химическом справочнике ChEBI эта структура относится к классу «methoxybenzoic acid». Для неё указаны формула C58H88O4 и формальный заряд 0.
Что означает эта роль
При поиске метаболита в биологической пробе учитывают матрицу, способ пробоподготовки и аналитическую платформу. Сигнал с подходящей массой может принадлежать нескольким структурам. Для уверенной идентификации используют дополнительные признаки, например время удерживания или характер фрагментации.
Как прочитать формулу и массу
Формула C58H88O4 задаёт следующий состав одной структурной единицы: C — 58, H — 88, O — 4. Средняя масса составляет 849.338 Да, а моноизотопная масса — 848.66826 Да. Первую используют при расчётах с усреднённым изотопным составом, вторую сопоставляют с теоретической точной массой определённого изотопного состава. В масс-спектре прибор регистрирует отношение массы к заряду иона. Для сравнения с пиком учитывают ионную форму и возможное образование аддукта.
Пример пересчёта единиц
Если в справочном примере содержание 3-decaprenyl-4-hydroxy-5-methoxybenzoic acid равно 10 мкмоль/л, то для формы C58H88O4 это приблизительно 8,49338 мг/л. Для такого пересчёта количество вещества умножают на молярную массу и согласуют приставки единиц. При использовании стандарта в виде соли или гидрата сначала проверяют, к какой форме отнесена заявленная концентрация. Пример показывает перевод единиц и не является референсным интервалом.
Как различить записи
В ChEBI указана прямая связь: 3-decaprenyl-4-hydroxy-5-methoxybenzoic acid — сопряжённая кислота для «3-decaprenyl-4-hydroxy-5-methoxybenzoate». У этих форм различаются число протонов и заряд. При переносе результата проверяют, какая форма была выбрана для расчёта массы.
Справочные данные
- Международное название
- 3-decaprenyl-4-hydroxy-5-methoxybenzoic acid
- Класс ChEBI
- methoxybenzoic acid
- Формула
- C58H88O4
- Формальный заряд
- 0
- Средняя масса, Да
- 849.338
- Моноизотопная масса, Да
- 848.66826
- InChIKey
- WCQCNOIKXGNDLX-RDSVHMIISA-N
- Другие обозначения в ChEBI
- 4-hydroxy-3-methoxy-5-decaprenylbenzoic acid, all-trans-3-decaprenyl-4-hydroxy-5-methoxybenzoic acid, all-trans-4-hydroxy-3-methoxy-5-decaprenylbenzoic acid
ChEBI, выпуск 257, CHEBI:50776 · EMBL-EBI · CC BY 4.0