Клиническая биохимия
1D-myo-inositol 1,4-bisphosphate(4-)
1D-myo-inositol 1,4-bisphosphate(4-) — метаболит человека. В химическом справочнике ChEBI эта структура относится к классу «inositol phosphate oxoanion». Для неё указаны формула C6H10O12P2 и формальный заряд -4.
Что означает эта роль
При поиске метаболита в биологической пробе учитывают матрицу, способ пробоподготовки и аналитическую платформу. Сигнал с подходящей массой может принадлежать нескольким структурам. Для уверенной идентификации используют дополнительные признаки, например время удерживания или характер фрагментации.
Как прочитать формулу и массу
Формула C6H10O12P2 задаёт следующий состав одной структурной единицы: C — 6, H — 10, O — 12, P — 2. Средняя масса составляет 336.082 Да, а моноизотопная масса — 335.96694 Да. Первую используют при расчётах с усреднённым изотопным составом, вторую сопоставляют с теоретической точной массой определённого изотопного состава. В масс-спектре прибор регистрирует отношение массы к заряду иона. Для сравнения с пиком учитывают ионную форму и возможное образование аддукта.
Пример пересчёта единиц
Если в справочном примере содержание 1D-myo-inositol 1,4-bisphosphate(4-) равно 10 мкмоль/л, то для формы C6H10O12P2 это приблизительно 3,36082 мг/л. Для такого пересчёта количество вещества умножают на молярную массу и согласуют приставки единиц. При использовании стандарта в виде соли или гидрата сначала проверяют, к какой форме отнесена заявленная концентрация. Пример показывает перевод единиц и не является референсным интервалом.
Как различить записи
В ChEBI указана прямая связь: 1D-myo-inositol 1,4-bisphosphate(4-) — сопряжённое основание для «1D-myo-inositol 1,4-bisphosphate». У этих форм различаются число протонов и заряд. При переносе результата проверяют, какая форма была выбрана для расчёта массы.
Справочные данные
- Международное название
- 1D-myo-inositol 1,4-bisphosphate(4-)
- Класс ChEBI
- inositol phosphate oxoanion
- Формула
- C6H10O12P2
- Формальный заряд
- -4
- Средняя масса, Да
- 336.082
- Моноизотопная масса, Да
- 335.96694
- InChIKey
- PELZSPZCXGTUMR-RTPHHQFDSA-J
- Другие обозначения в ChEBI
- 1D-myo-inositol 1,4-bis(phosphate), 1D-myo-inositol 1,4-bis(phosphate), 1D-myo-inositol 1,4-bisphosphate, 1D-myo-inositol 1,4-bisphosphate
ChEBI, выпуск 257, CHEBI:58282 · EMBL-EBI · CC BY 4.0