Клиническая биохимия
L-homocysteine thiolactone
L-homocysteine thiolactone — метаболит человека. В химическом справочнике ChEBI эта структура относится к классу «tetrahydrothiophenes». Для неё указаны формула C4H7NOS и формальный заряд 0.
Что означает эта роль
При поиске метаболита в биологической пробе учитывают матрицу, способ пробоподготовки и аналитическую платформу. Сигнал с подходящей массой может принадлежать нескольким структурам. Для уверенной идентификации используют дополнительные признаки, например время удерживания или характер фрагментации.
Как прочитать формулу и массу
Формула C4H7NOS задаёт следующий состав одной структурной единицы: C — 4, H — 7, N — 1, O — 1, S — 1. Средняя масса составляет 117.173 Да, а моноизотопная масса — 117.02483 Да. Первую используют при расчётах с усреднённым изотопным составом, вторую сопоставляют с теоретической точной массой определённого изотопного состава. В масс-спектре прибор регистрирует отношение массы к заряду иона. Для сравнения с пиком учитывают ионную форму и возможное образование аддукта.
Пример пересчёта единиц
Если в справочном примере содержание L-homocysteine thiolactone равно 10 мкмоль/л, то для формы C4H7NOS это приблизительно 1,17173 мг/л. Для такого пересчёта количество вещества умножают на молярную массу и согласуют приставки единиц. При использовании стандарта в виде соли или гидрата сначала проверяют, к какой форме отнесена заявленная концентрация. Пример показывает перевод единиц и не является референсным интервалом.
Как различить записи
В ChEBI указана прямая связь: L-homocysteine thiolactone — сопряжённое основание для «L-homocysteine thiolactone(1+)». У этих форм различаются число протонов и заряд. При переносе результата проверяют, какая форма была выбрана для расчёта массы.
Справочные данные
- Международное название
- L-homocysteine thiolactone
- Класс ChEBI
- tetrahydrothiophenes
- Формула
- C4H7NOS
- Формальный заряд
- 0
- Средняя масса, Да
- 117.173
- Моноизотопная масса, Да
- 117.02483
- InChIKey
- KIWQWJKWBHZMDT-VKHMYHEASA-N
- CAS RN
- 2338-04-7
- Другие обозначения в ChEBI
- (3S)-3-aminodihydrothiophen-2(3H)-one, (3S)-3-aminodihydrothiophen-2(3H)-one, (S)-3-aminodihydro-2(3H)-thiophenone, homocysteine thiolactone
ChEBI, выпуск 257, CHEBI:60315 · EMBL-EBI · CC BY 4.0