Флуорохромы
pacific blue succinimidyl ester
pacific blue succinimidyl ester — флуорохром. В химическом справочнике ChEBI эта структура относится к классу «organofluorine compound». Для неё указаны формула C14H7F2NO7 и формальный заряд 0.
Что означает эта роль
Для регистрации флуоресценции учитывают две полосы спектра. Источник должен возбуждать молекулу, а фильтр детектора должен пропускать излучение образца. Яркость зависит также от растворителя, концентрации и условий наблюдения. Поэтому для выбора фильтра нужны спектральные данные именно выбранного красителя.
Как прочитать формулу и массу
Формула C14H7F2NO7 задаёт следующий состав одной структурной единицы: C — 14, H — 7, F — 2, N — 1, O — 7. Средняя масса составляет 339.206 Да, а моноизотопная масса — 339.01906 Да. Первую используют при расчётах с усреднённым изотопным составом, вторую сопоставляют с теоретической точной массой определённого изотопного состава. В масс-спектре прибор регистрирует отношение массы к заряду иона. Для сравнения с пиком учитывают ионную форму и возможное образование аддукта.
Пример пересчёта единиц
Если в справочном примере содержание pacific blue succinimidyl ester равно 10 мкмоль/л, то для формы C14H7F2NO7 это приблизительно 3,39206 мг/л. Для такого пересчёта количество вещества умножают на молярную массу и согласуют приставки единиц. При использовании стандарта в виде соли или гидрата сначала проверяют, к какой форме отнесена заявленная концентрация. Пример показывает перевод единиц и не является референсным интервалом.
Как различить записи
При сверке лабораторного стандарта сначала сопоставляют название pacific blue succinimidyl ester и формулу C14H7F2NO7, затем проверяют полный InChIKey. Отдельно читают паспорт образца: чистота, растворитель, концентрация и условия хранения относятся к конкретной партии. Эти сведения отсутствуют в структурном идентификаторе.
Справочные данные
- Международное название
- pacific blue succinimidyl ester
- Класс ChEBI
- organofluorine compound
- Формула
- C14H7F2NO7
- Формальный заряд
- 0
- Средняя масса, Да
- 339.206
- Моноизотопная масса, Да
- 339.01906
- InChIKey
- NZYXABPVYJRICY-UHFFFAOYSA-N
- Другие обозначения в ChEBI
- pacific blue N-hydroxysuccinimidyl ester
ChEBI, выпуск 257, CHEBI:63240 · EMBL-EBI · CC BY 4.0