Флуорохромы
tetramethylrhodamine ethyl ester(1+)
tetramethylrhodamine ethyl ester(1+) — флуорохром. В химическом справочнике ChEBI эта структура относится к классу «органические катионы». Для неё указаны формула C26H27N2O3 и формальный заряд 1.
Что означает эта роль
Для регистрации флуоресценции учитывают две полосы спектра. Источник должен возбуждать молекулу, а фильтр детектора должен пропускать излучение образца. Яркость зависит также от растворителя, концентрации и условий наблюдения. Поэтому для выбора фильтра нужны спектральные данные именно выбранного красителя.
Как прочитать формулу и массу
Формула C26H27N2O3 задаёт следующий состав одной структурной единицы: C — 26, H — 27, N — 2, O — 3. Средняя масса составляет 415.513 Да, а моноизотопная масса — 415.20162 Да. Первую используют при расчётах с усреднённым изотопным составом, вторую сопоставляют с теоретической точной массой определённого изотопного состава. В масс-спектре прибор регистрирует отношение массы к заряду иона. Для сравнения с пиком учитывают ионную форму и возможное образование аддукта.
Пример пересчёта единиц
Если в справочном примере содержание tetramethylrhodamine ethyl ester(1+) равно 10 мкмоль/л, то для формы C26H27N2O3 это приблизительно 4,15513 мг/л. Для такого пересчёта количество вещества умножают на молярную массу и согласуют приставки единиц. При использовании стандарта в виде соли или гидрата сначала проверяют, к какой форме отнесена заявленная концентрация. Пример показывает перевод единиц и не является референсным интервалом.
Как различить записи
В том же классе «organic cation» описано другое соединение — 1-methylpyrrolinium с формулой C5H10N. Общая классификация удобна для поиска родственных веществ. При переносе результата эксперимента важно сравнить формулы, обозначения и точную структуру исследованного материала.
Справочные данные
- Международное название
- tetramethylrhodamine ethyl ester(1+)
- Класс ChEBI
- organic cation
- Формула
- C26H27N2O3
- Формальный заряд
- 1
- Средняя масса, Да
- 415.513
- Моноизотопная масса, Да
- 415.20162
- InChIKey
- PQMJQYONVLIFOV-UHFFFAOYSA-N
- Другие обозначения в ChEBI
- TMRE
- Химическая группа
- органические катионы
ChEBI, выпуск 257, CHEBI:78721 · EMBL-EBI · CC BY 4.0