Клиническая биохимия
erythro-4-hydroxy-L-glutamate(1-)
erythro-4-hydroxy-L-glutamate(1-) — метаболит человека. В химическом справочнике ChEBI эта структура относится к классу «dicarboxylic acid monoanion». Для неё указаны формула C5H8NO5 и формальный заряд -1.
Что означает эта роль
При поиске метаболита в биологической пробе учитывают матрицу, способ пробоподготовки и аналитическую платформу. Сигнал с подходящей массой может принадлежать нескольким структурам. Для уверенной идентификации используют дополнительные признаки, например время удерживания или характер фрагментации.
Как прочитать формулу и массу
Формула C5H8NO5 задаёт следующий состав одной структурной единицы: C — 5, H — 8, N — 1, O — 5. Средняя масса составляет 162.121 Да, а моноизотопная масса — 162.0408 Да. Первую используют при расчётах с усреднённым изотопным составом, вторую сопоставляют с теоретической точной массой определённого изотопного состава. В масс-спектре прибор регистрирует отношение массы к заряду иона. Для сравнения с пиком учитывают ионную форму и возможное образование аддукта.
Пример пересчёта единиц
Если в справочном примере содержание erythro-4-hydroxy-L-glutamate(1-) равно 10 мкмоль/л, то для формы C5H8NO5 это приблизительно 1,62121 мг/л. Для такого пересчёта количество вещества умножают на молярную массу и согласуют приставки единиц. При использовании стандарта в виде соли или гидрата сначала проверяют, к какой форме отнесена заявленная концентрация. Пример показывает перевод единиц и не является референсным интервалом.
Как различить записи
В ChEBI указана прямая связь: erythro-4-hydroxy-L-glutamate(1-) — сопряжённое основание для «erythro-4-hydroxy-L-glutamic acid». У этих форм различаются число протонов и заряд. При переносе результата проверяют, какая форма была выбрана для расчёта массы.
Справочные данные
- Международное название
- erythro-4-hydroxy-L-glutamate(1-)
- Класс ChEBI
- dicarboxylic acid monoanion
- Формула
- C5H8NO5
- Формальный заряд
- -1
- Средняя масса, Да
- 162.121
- Моноизотопная масса, Да
- 162.0408
- InChIKey
- HBDWQSHEVMSFGY-STHAYSLISA-M
- Другие обозначения в ChEBI
- (2S,4R)-2-ammonio-4-hydroxypentanedioate, (4S)-4-hydroxy-L-glutamate, (4S)-4-hydroxy-L-glutamate, (4S)-4-hydroxy-L-glutamate
ChEBI, выпуск 257, CHEBI:6331 · EMBL-EBI · CC BY 4.0