Клиническая биохимия
(R)-icosanoylcarnitine
(R)-icosanoylcarnitine — метаболит человека. В химическом справочнике ChEBI эта структура относится к классу «saturated fatty acyl-L-carnitine». Для неё указаны формула C27H53NO4 и формальный заряд 0.
Что означает эта роль
При поиске метаболита в биологической пробе учитывают матрицу, способ пробоподготовки и аналитическую платформу. Сигнал с подходящей массой может принадлежать нескольким структурам. Для уверенной идентификации используют дополнительные признаки, например время удерживания или характер фрагментации.
Как прочитать формулу и массу
Формула C27H53NO4 задаёт следующий состав одной структурной единицы: C — 27, H — 53, N — 1, O — 4. Средняя масса составляет 455.724 Да, а моноизотопная масса — 455.39746 Да. Первую используют при расчётах с усреднённым изотопным составом, вторую сопоставляют с теоретической точной массой определённого изотопного состава. В масс-спектре прибор регистрирует отношение массы к заряду иона. Для сравнения с пиком учитывают ионную форму и возможное образование аддукта.
Пример пересчёта единиц
Если в справочном примере содержание (R)-icosanoylcarnitine равно 10 мкмоль/л, то для формы C27H53NO4 это приблизительно 4,55724 мг/л. Для такого пересчёта количество вещества умножают на молярную массу и согласуют приставки единиц. При использовании стандарта в виде соли или гидрата сначала проверяют, к какой форме отнесена заявленная концентрация. Пример показывает перевод единиц и не является референсным интервалом.
Как различить записи
В том же классе «saturated fatty acyl-L-carnitine» описано другое соединение — O-octanoyl-L-carnitine с формулой C15H29NO4. Общая классификация удобна для поиска родственных веществ. При переносе результата эксперимента важно сравнить формулы, обозначения и точную структуру исследованного материала.
Справочные данные
- Международное название
- (R)-icosanoylcarnitine
- Класс ChEBI
- saturated fatty acyl-L-carnitine
- Формула
- C27H53NO4
- Формальный заряд
- 0
- Средняя масса, Да
- 455.724
- Моноизотопная масса, Да
- 455.39746
- InChIKey
- SVJLJQBGUITFLI-RUZDIDTESA-N
- Другие обозначения в ChEBI
- (3R)-3-(icosanoyloxy)-4-(trimethylazaniumyl)butanoate, (3R)-3-(icosanoyloxy)-4-(trimethylazaniumyl)butanoate, (R)-arachidoylcarnitine, (R)-arachidoylcarnitine
ChEBI, выпуск 257, CHEBI:84645 · EMBL-EBI · CC BY 4.0