Клиническая биохимия
O-hexanoyl-L-carnitine
O-hexanoyl-L-carnitine — метаболит человека. В химическом справочнике ChEBI эта структура относится к классу «saturated fatty acyl-L-carnitine». Для неё указаны формула C13H25NO4 и формальный заряд 0.
Что означает эта роль
При поиске метаболита в биологической пробе учитывают матрицу, способ пробоподготовки и аналитическую платформу. Сигнал с подходящей массой может принадлежать нескольким структурам. Для уверенной идентификации используют дополнительные признаки, например время удерживания или характер фрагментации.
Как прочитать формулу и массу
Формула C13H25NO4 задаёт следующий состав одной структурной единицы: C — 13, H — 25, N — 1, O — 4. Средняя масса составляет 259.346 Да, а моноизотопная масса — 259.17836 Да. Первую используют при расчётах с усреднённым изотопным составом, вторую сопоставляют с теоретической точной массой определённого изотопного состава. В масс-спектре прибор регистрирует отношение массы к заряду иона. Для сравнения с пиком учитывают ионную форму и возможное образование аддукта.
Пример пересчёта единиц
Если в справочном примере содержание O-hexanoyl-L-carnitine равно 10 мкмоль/л, то для формы C13H25NO4 это приблизительно 2,59346 мг/л. Для такого пересчёта количество вещества умножают на молярную массу и согласуют приставки единиц. При использовании стандарта в виде соли или гидрата сначала проверяют, к какой форме отнесена заявленная концентрация. Пример показывает перевод единиц и не является референсным интервалом.
Как различить записи
В выборке есть ещё одно соединение с формулой C13H25NO4 — O-hexanoylcarnitine. Структурные ключи этих записей различаются. Поиск только по формуле объединит оба результата. Чтобы выбрать нужное соединение для сравнения, проверяют полное название и структурный идентификатор.
Справочные данные
- Международное название
- O-hexanoyl-L-carnitine
- Класс ChEBI
- saturated fatty acyl-L-carnitine
- Формула
- C13H25NO4
- Формальный заряд
- 0
- Средняя масса, Да
- 259.346
- Моноизотопная масса, Да
- 259.17836
- InChIKey
- VVPRQWTYSNDTEA-LLVKDONJSA-N
- CAS RN
- 22671-29-0
- Другие обозначения в ChEBI
- (3R)-3-(hexanoyloxy)-4-(trimethylazaniumyl)butanoate, (3R)-3-(hexanoyloxy)-4-(trimethylazaniumyl)butanoate, (R)-Caproylcarnitine, (R)-hexanoylcarnitine
ChEBI, выпуск 257, CHEBI:84834 · EMBL-EBI · CC BY 4.0