ИНФОМЕД +
Молекулярная диагностика

Молекулярный вариант · Справка по структурированным данным

Вариант LCAT p.Lys39Ter

Вариант кодирующей последовательности гена LCAT. В транскрипте NM_000229.2 он обозначен как c.115A>T. Изменение образует стоп-кодон в позиции 39, где в референсной белковой последовательности находится аминокислота «лизин». В использованной выгрузке обобщённая оценка значимости для наследственных состояний — «вероятно патогенный». Оценка относится к записи варианта и указанным в источнике состояниям.

Ген
LCAT
Транскрипт RefSeq
NM_000229.2
Обозначение на уровне кДНК
c.115A>T
Обозначение на уровне белка
p.Lys39Ter
Координата GRCh38
16:67943987
Дата последней оценки в записи
May 08, 2024
Основание статуса ClinVar
несколько заявителей, критерии представлены, противоречий нет
Оценка в источнике
Likely pathogenic
Состояния в исходной записи
Fish-eye disease;Norum disease|LCAT-related disorder
Исходное наименование
NM_000229.2(LCAT):c.115A>T (p.Lys39Ter)
Идентификатор источника
3581220

Связанные термины

Каталог ИНФОМЕД · Лабораторное оборудование
Источник и редакция

NCBI ClinVar, запись Variation ID 3581220. Источник объединяет оценки заявителей. Оценки могут обновляться. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/clinvar/variation/3581220/